فیلم قناری سیاه داستان زنی به نام "آوری گریوز" را روایت می‌کند. آوری یک مامور با تجربه و حرفه‌ای در سرویس اطلاعاتی است که درگیر یک مأموریت خطرناک می‌شود. در این ماموریت، او باید با دشمنان سرسختی که قصد دارند اطلاعات حساس و امنیتی را از او بگیرند، مقابله کند. ماجرا از جایی پیچیده‌تر می‌شود که این دشمنان، برای تحت فشار قرار دادن او، عزیزترین افراد زندگی‌اش را تهدید می‌کنند. حالا آوری باید با تکیه بر هوش و مهارت‌هایش تلاش کند تا نه تنها جان خود را نجات دهد، بلکه از اطلاعات حساس نیز محافظت کرده و از امنیت خانواده‌اش اطمینان حاصل کند.